厦门大学附属中山医院前身为厦门中山医院，有近80年的历史。目前，拥有床位1200张，教职员工1800余名（含高级专家242人，硕士、博士以上学历250余名）。年门、急诊量达150万余人次，收住病人近3万人次，成为集医疗、教学、科研、预防保健于一体的三级现代化综合性医院。
2006年，经国家人事部严格遴选，我院以强大的科研能力、丰富的科研成果、优良的管理水平、良好的社会效益得到有关专家的一致好评，以优异的成绩被国家人事部批准设立厦门大学附属中山医院博士后工作站。
医院设有36个临床、医技科室。拥有厦门心脏中心、临床检验中心二个医学中心，拥有消化内科、普通外科、肝胆外科、神经内科、神经外科、骨科等市级重点学科，拥有血液科、老年病康复科、病理科、皮肤科等市级规划重点专科，急救医学、妇产科、呼吸内科、肾内科、耳鼻喉科、口腔科、整形外科等学科具有较强优势。拥有国际一流水平的64层螺旋容积CT、1.5T双梯度超导核磁共振仪、罗茨双模块全自动生化分析仪、数字双屏板双C臂血管造影机以及ECT、DSA、DR、彩色B超、血液透析机、双气囊电子小肠镜、超声电子内窥镜等现代化仪器设备，设备总值达2.2亿元。
医院作为厦门大学附属医院，拥有内科学、外科学二级学科硕士学位授予点。设有《诊断学》、《内科学》、《外科学》、《妇产科学》、《儿科学》等12个教研室。拥有一支由教授、副教授、研究生导师为主力所组成的近200名的教师队伍。承担厦门大学等省内外大、中专院校的临床、检验、护理、药剂等专业的实习任务及临床医学研究生的教学及管理工作。每年获国家、省、市科技进步奖4-5项。目前拥有部、省、市、卫生局科研基金课题200余项。每年发表医学科技论文200多篇，其中有多篇被SCI、MEDLINE源期刊收录。
职工积极开展精神文明建设，秉持“团结、敬业、求实、创新”的医院精神，坚持“以病人为中心”的宗旨，在医院改革和管理、精神文明和政治文明建设方面取得可喜成果，连续多年被评为省、市文明单位。2003年度被评为福建省抗击非典先进集体、2004年荣获全国卫生系统先进集体、2005年荣获全国精神文明建设工作先进单位光荣称号。
新世纪给医院发展带来新机遇，医院布局将按照教育部直属国家重点大学附属医院的建设要求，根据现代医院管理和“以病人为中心”的总体思路全面规划。建筑面积达5.6万平方米的住院---医技楼群即将竣工投入使用，门诊科教大楼即将投入建设。医院的临床、教学、科研、预防保健水平将跃上新的台阶，一所高水平人性化的绿色三甲医院将展现在世人面前。
